庄天（元华 饰）和董兆匡（张国强 饰）曾经是行业内最最有名的一堆捉妖天师，然而清末民初的一场社会大变革让捉妖师变成了宣扬封建迷信的神棍，无奈之下，两人只得前往广州，在那里寻得了一份警察的差事。虽然不再是捉妖师了，但董兆匡却依然忘记不了昔日的辉煌，他结识了商人阿堂（任世官 饰），阿堂表面上是经营正当生意的商人，实际上却干着贩毒的勾当，董兆匡听信了他的花言巧语，开始利用僵尸来帮助他运毒。董兆匡的徒弟晓东（陈晓东 饰）爱上了阿堂的女儿翠玲（谭小环 饰），然而董兆匡早已经开始打起了翠玲的主意。
这次故事的舞台发生在海关入境处。作为入境处总入境助理的方浚杰（郭晋安 饰）一直以来都安于现状，因为曾经和上司麦启铭（姜大伟 饰）发生过冲突，对升值也不再抱有希望。和在深圳相识的内地女子张思敏（姚嘉妮 饰）结婚，终于等来了申请成功，本以为就此可以一家团聚的浚杰，却因为大嫂对妻子的排挤，矛盾颇多。为家务事烦恼的浚杰接到了更大噩耗是，妻子居然多年前曾在香港犯案，这让正义感颇强的浚杰无法接受。在妻子离开的过程中，浚杰的同期好友叶安琪（蒙嘉慧 饰）对他照顾有加，在这当中，浚杰同安琪的感情在滋长。而后，浚杰又认识了港口管制组入境主任欧顺风（邓健泓 饰），从误会到冰释前嫌，二人迅速结为好友。而浚杰也也迎来了其事业的转机…
忍不住查看男友手机的初见（黄翠茹 饰）意外的发现了男友和其他女孩的暧昧讯息，感情受到伤害的初见黯然神伤，再也无法面对男友一如既往的甜言蜜语。天送（黄浩然 饰）的姐姐和姐夫死于一场火灾，心中充满了对于姐姐的愧疚，天送毅然放弃了自己成为玻璃艺术家的梦想，收养了姐姐的女儿悠悠（杨铠凝 饰），没想到他对悠悠的无微不至在无形之中给予了恋人蔡妍（姚子羚 饰）巨大的心理压力，如积月累之间，两人渐行渐远。
高收成（马德钟 饰）是一名律所合伙人，一次偶然中，他在一个名叫“人有相似”的网站上和自己的初恋俞风（汤洛雯 饰）重逢了。这个网站专门用以寻找样貌相似的人，而俞风所寻找的，正是和高收成长相相似的男人，没想到还真有，这个男人的名字叫做巫祺男（马德钟 饰）。
资深花钮导师郭罗美兰（鲍起静 饰）面临着家庭成员各自的问题，包括长子（马德钟 饰）生意失败离婚、二女（车婉婉 饰）关系疏离、幼子失业（杨明 饰）等情况。在即将迎来自己的70岁生日之际，她意识到家庭中存在的问题，希望能够帮助儿女们解决困境，同时计划与爱徒合作传承手艺。
小小大丈夫讲述邵小邻觉得上帝真的没有背弃她，在她惨到爆时，上天赐给她一个完美的男人──贺悉寒。嗐～～他真的很完美，从头到脚都帅到无可挑剔，人超级“耐斯”，对她又热情如火，真是既中看又中用，从里到外把她伺候得服服贴贴，犹如置身天堂……就在她为他深深著迷、连心都给他了之后，才发现──这男人的年纪竟然比她小！妈呀～这世界虽然很流行姊弟恋，但她根本不想赶这种流行好吗？！她一向爱的是年纪大的大男人，现在被个小子管东管西是怎样？臭小子！竟然没先讲就把姊姊给吃了，呜呜～～她要抗议误上贼船啦！不知现在回头还来得及吗…
香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。
1993年，特技演员烈风（方中信 饰）与女友贺千惠（萱萱 饰）、好友凌克洋（林保怡 饰）前往西安旅游，却意外地在古墓中见到了幼年时的救命恩人步荆红（王菲 饰），他震惊于步荆红20年如一日的容貌并展开了调查。原来步荆红是秦朝时获得长生不老药的舞姬胭脂，孤独千年，只为寻找变 回正常人的秘方，而她不知的是，同样获得了不死之身的秦将军嬴战（单立文 饰）一直都在追寻她的下落。烈风在寻找真相的同时渐渐爱上了步荆红，而荆红却一再压抑，拒绝感情。命运交织，改名为盛世秦的嬴战终于找到了荆红，而他依然不改残暴本性，祸害人间，想尽办法拆散烈风与荆红，并且还想彻底破坏荆红成为普通人的愿望。
秦朝末年，苛捐杂税重如山，民不聊生。富家千金吕雉（张可颐 饰）虽为女儿身，却胸怀大志，女扮男装外出寻找有志之士。她发现了时任泗水亭长刘邦（郑少秋 饰）宅心仁厚，对他渐渐生出好感。项羽（江华 饰）密谋起义，为了招揽黥面贼英布，单枪匹马闯入秦军军中将英布的仇人将领赵常斩杀，终于将英布收到帐下。刘邦发现了项羽的秘密。项羽本来想杀他灭口，但刘邦却对他表现得十分敬畏，哭诉了暴秦令人民生活凄苦，因此愿为他效力推翻暴君。于是项羽被感动了，决定招揽他，两人更以兄弟相称。随后，吕雉主动嫁给了刘邦，她知道自己将会辅助刘邦成就大业。秦始皇病逝，赵高扶立秦二世，秦二世荒淫无度，更引得天下大乱，群雄并起。项羽时势造英雄，终于揭竿起义了！
赵抱石（陈启泰 饰）是一位精明强干的律师，某日，身世神秘的女子区学儿（张可颐 饰）找到了他，希望他能够为自己辩护。区学儿被卷入了一宗背景十分复杂的遗产争夺战之中，情况不容乐观，而区学儿似乎十分倾心于赵抱石，于有意无意之中向他放电，这令已经结了婚的赵抱石心中十分难耐。原来，这所有的一切都是区学儿一手设计的阴谋，她勾引赵抱石不过是为了报复赵抱石的妻子周芷珊（苏玉华 饰）。最终，区学儿的阴谋得逞了，赵抱石彻底坠入了情网，直到此时，区学儿才惊觉自己亦深深的爱上了正直勇敢的赵抱石。关家乐（潘志文 饰）是区学儿曾经的情人，他的刑满释放给区学儿带来了不小的麻烦。
碧水镇原本是一座荒僻的山城，直到孤女蔡小花无意中发现了金矿，才让这座城市焕发出勃勃生机，成为繁华盛景。富家子乐天看到这里的商机，决定在这里开设菜馆。然而，与他有着仇怨的屈仁威也选择了这里开店，使得两人陷入了竞争之中。在这场商业竞争中，乐天得到了江湖小子林奕龙和陈阿娇的帮助，三人成为了兄弟，共同对抗屈仁威。屈仁威对乐天的生意兴旺感到不满，便高薪聘请了上海小姐慧云李为菜馆表演，吸引了全镇男人的目光，甚至连乐天三兄弟也为之倾倒。为了取悦慧云李，兄弟之间产生了矛盾。虽然慧云李对乐天更为委婉，但小花却暗恋乐天，不得不默默承受心痛。尽管知道慧云李对乐天并非真心，但为了帮助乐天，兄弟们还是努力追求她。
柏飞（陈山聪饰）、姜曦文（刘佩玥饰）、刘力（林子善饰）投身警队后师从罗友邦，四师徒感情深厚。三年前的追捕行动，友邦殉职、刘力重伤，曦文归咎于柏飞急功近利引致悲剧，友情破裂。一宗连环谋杀案再将柏飞、曦文联系起來，卧底温嘉莉（刘颖镟饰）奉命混入犯罪集团，却重遇前男友招俊朗（张振朗饰），关系纠缠不清。柏飞、曦文接二连三收到神秘讯息提示，上级遂将两组探员合并成神秘讯息情报科，侦查多宗扑朔迷离的命案。由手机助理发出的提示为何每每能引领团队超前破案，「她」是敌是友？
卓一航文武双全，获太子赏识提拔入宫。练霓裳为野狼所养，后得剑客凌慕华传授剑艺，出手狠辣，被冠以「玉罗刹」之外号。一次练被朝廷高手围剿受伤，幸得卓出手相救，并对其悉心照料。练初尝真情，深深受到打动，更向其表白爱意，惟卓因未能摒弃门户之见而拒之，练伤心不已。后卓再遇练，终为练之真情感动。二人更联手对抗奸臣魏忠贤及东西厂特务。一次，卓被师兄挑拨而与练对敌，更出手伤她，练肝肠寸断，伤心至一夜白头。卓悔咎不已，决抛一切功名找练，惜为时已晚，练已飘然远去.....
